根據(jù)第八屆全國人民代表大會(huì)第一次會(huì)議批準(zhǔn)的國務(wù)院機(jī)構(gòu)改革方案，保留水利部。水利部要根據(jù)水利行業(yè)的特點(diǎn)，適應(yīng)建立社會(huì)主義市場經(jīng)濟(jì)體制的要求，本著精簡、統(tǒng)一、效能的原則，轉(zhuǎn)變職能，理順關(guān)系，精兵簡政，提高效率，深化水利改革，促進(jìn)水利事業(yè)的發(fā)展。

　　一、職能轉(zhuǎn)變

　　按照國家行政管理體制改革的總體要求，水利部要進(jìn)一步轉(zhuǎn)變觀念，轉(zhuǎn)變職能，強(qiáng)化水利行業(yè)管理和水資源的統(tǒng)一管理。加強(qiáng)水利發(fā)展戰(zhàn)略、規(guī)劃和政策、法規(guī)及關(guān)系國計(jì)民生的大江大河大湖治理、防汛抗旱、農(nóng)村水利、水土保持等方面的職能，搞好規(guī)劃、協(xié)調(diào)、監(jiān)督、管理、服務(wù)。把人、財(cái)、物的具體管理和專業(yè)性、技術(shù)性較強(qiáng)的業(yè)務(wù)工作轉(zhuǎn)移給事業(yè)單位，把屬于企業(yè)的權(quán)利下放給企業(yè)。

　　加強(qiáng)和充分發(fā)揮流域機(jī)構(gòu)的作用。流域機(jī)構(gòu)作為水利部的派出機(jī)構(gòu)，在本流域內(nèi)行使水行政主管部門的職責(zé)。逐步建立起水利部、流域機(jī)構(gòu)和地方水行政主管部門分層次、分級(jí)管理的國家水行政管理體制。

　　二、主要職責(zé)

　　水利部是國務(wù)院主管水行政的職能部門，統(tǒng)一管理全國水資源和河道、水庫、湖泊，主管全國防汛抗旱和水土保持工作，負(fù)責(zé)全國水利行業(yè)的管理。主要職責(zé)是：

　�。ㄒ唬┴�(fù)責(zé)《中華人民共和國水法》、《中華人民共和國水土保持法》等法律、法規(guī)的組織實(shí)施和監(jiān)督檢查。研究制訂水利工作的方針、政策、法規(guī)和規(guī)章制度。

　　（二）組織制訂全國水利發(fā)展戰(zhàn)略規(guī)劃、中長期和年度計(jì)劃。組織制訂全國主要江河、國際河流（湖泊）和省際河流（湖泊）的流域（區(qū)域）綜合規(guī)劃和有關(guān)專業(yè)規(guī)劃并負(fù)責(zé)監(jiān)督實(shí)施。

　　（三）統(tǒng)一管理全國水資源。負(fù)責(zé)組織全國水資源的監(jiān)測和調(diào)查評(píng)價(jià)。會(huì)同有關(guān)部門制訂全國和跨省水長期供求計(jì)劃、水量分配方案并負(fù)責(zé)監(jiān)督管理。組織實(shí)施取水許可制度。歸口管理全國節(jié)約用水工作。對(duì)水資源保護(hù)實(shí)施監(jiān)督管理。受國務(wù)院委托協(xié)調(diào)處理部門間和省、自治區(qū)、直轄市間的水事糾紛。

　�。ㄋ模┲鞴苋珖�河道、水庫、湖泊（包括人工水道、行洪區(qū)、蓄洪區(qū)、滯洪區(qū)）、河口灘涂和海堤等水域及其岸線。負(fù)責(zé)大江大河大湖的綜合治理和開發(fā)。

　�。ㄎ澹┲鞴苋珖�防汛抗旱工作，負(fù)責(zé)國家防汛抗旱總指揮部的日常工作。

　�。�六）主管全國水土保持工作。

　�。ㄆ撸┕芾砣珖�農(nóng)村水利和鄉(xiāng)鎮(zhèn)供水、人畜飲水工作。

　�。ò耍┴�(fù)責(zé)城市地表水供水水源建設(shè)、水環(huán)境保護(hù)等城市水利工作。

　�。ň牛┙M織建設(shè)和管理水利系統(tǒng)的水電站及小電網(wǎng)。負(fù)責(zé)國務(wù)院安排的第二批農(nóng)村水電電氣化縣建設(shè)。

　　（十）配合國家綜合經(jīng)濟(jì)管理部門制訂有關(guān)水利的財(cái)務(wù)政策及價(jià)格、稅收、信貸等經(jīng)濟(jì)調(diào)節(jié)措施并組織實(shí)施。按照國家有關(guān)規(guī)定監(jiān)督水利系統(tǒng)國有資產(chǎn)的保值增值。

　�。ㄊ�一）對(duì)全國水文工作實(shí)行行業(yè)管理。

　�。ㄊ�二）對(duì)全國水工程建設(shè)進(jìn)行行業(yè)管理，負(fù)責(zé)組織建設(shè)和管理具有控制性的或跨省（自治區(qū)、直轄市）的重要水工程。對(duì)全國水利工程、水利綜合經(jīng)營和水庫移民實(shí)行行業(yè)管理。

　�。ㄊ�三）負(fù)責(zé)管理水利科技、教育、國際合作，會(huì)同有關(guān)部門辦理國際河流的涉外事宜。指導(dǎo)和管理全國水利隊(duì)伍的建設(shè)。

　�。ㄊ�四）承辦國務(wù)院交辦的其他事項(xiàng)。

　　三、內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)

　　根據(jù)上述職責(zé)，水利部設(shè)13個(gè)職能司和機(jī)關(guān)黨委。

　　（一）辦公廳

　　協(xié)助部領(lǐng)導(dǎo)組織機(jī)關(guān)日常工作；對(duì)各司工作進(jìn)行綜合協(xié)調(diào)；負(fù)責(zé)重大會(huì)議的組織；負(fù)責(zé)對(duì)外宣傳、秘書、公文、政務(wù)信息、檔案、保衛(wèi)、保密、信訪工作及機(jī)關(guān)內(nèi)部規(guī)章制度建設(shè)。

　�。ǘ�）規(guī)劃計(jì)劃司

　　組織編制國家水利發(fā)展戰(zhàn)略、流域規(guī)劃、中長期計(jì)劃和年度計(jì)劃，會(huì)同有關(guān)部門制訂水長期供求計(jì)劃；負(fù)責(zé)大中型和直屬水利水電基建項(xiàng)目的建議書和可行性研究報(bào)告的立項(xiàng)申報(bào)和審批；組織協(xié)調(diào)流域開發(fā)工作；負(fù)責(zé)水利綜合統(tǒng)計(jì)工作。

　�。ㄈ�）水政水資源司

　　主管水利行業(yè)政策法規(guī)、體制改革和水利執(zhí)法工作；負(fù)責(zé)水資源統(tǒng)一管理和保護(hù)工作；負(fù)責(zé)組織實(shí)施取水許可制度和水資源費(fèi)征收管理制度；歸口協(xié)調(diào)省際和部門間的水事糾紛；主管全國節(jié)約用水和城市供水水源規(guī)劃工作；會(huì)同有關(guān)部門制訂跨省的水量分配方案并組織實(shí)施。

　�。ㄋ模┴�(cái)務(wù)司

　　負(fù)責(zé)全國水利行業(yè)的財(cái)務(wù)、會(huì)計(jì)管理；制訂水利行業(yè)各項(xiàng)經(jīng)濟(jì)調(diào)節(jié)措施；對(duì)水利資金和經(jīng)營管理進(jìn)行宏觀調(diào)節(jié)；對(duì)水利系統(tǒng)的國有固定資產(chǎn)進(jìn)行監(jiān)督管理；主管部屬單位的財(cái)務(wù)工作，指導(dǎo)全國水利綜合經(jīng)營。

　�。ㄎ澹┤耸聞趧�(dòng)司

　　負(fù)責(zé)部機(jī)關(guān)、直屬單位的機(jī)構(gòu)編制和人事管理工作；組織實(shí)施國家公務(wù)員制度；負(fù)責(zé)專業(yè)技術(shù)職務(wù)評(píng)聘工作；主管本行業(yè)勞動(dòng)工資、勞動(dòng)保護(hù)和社會(huì)保險(xiǎn)工作。

　�。�六）國際合作司

　　負(fù)責(zé)辦理政府間有關(guān)水利方面的涉外事宜，主管水利行業(yè)對(duì)外經(jīng)濟(jì)、技術(shù)合作與交流。

　　（七）科技教育司

　　負(fù)責(zé)編制全國水利科學(xué)技術(shù)和教育發(fā)展規(guī)劃；管理部屬科研機(jī)構(gòu)和院校；組織重大水利科學(xué)研究和技術(shù)推廣工作；主管水利行業(yè)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)、規(guī)程規(guī)范、技術(shù)和質(zhì)量監(jiān)督工作；歸口管理全國高中等院校水利類專業(yè)和水利行業(yè)職工培訓(xùn)工作。

　�。ò耍┙ㄔO(shè)司

　　組織和協(xié)調(diào)部屬重點(diǎn)水利水電工程的建設(shè)；組織重點(diǎn)建設(shè)項(xiàng)目的國家級(jí)驗(yàn)收；對(duì)全國水工程建設(shè)進(jìn)行行業(yè)管理；主管全國水利水電工程建設(shè)監(jiān)理工作。

　�。ň牛┧�電及農(nóng)村電氣化司

　　主管水利系統(tǒng)開發(fā)建設(shè)的水電，對(duì)農(nóng)村小水電站及小電網(wǎng)進(jìn)行歸口管理；組織實(shí)施全國第二批200個(gè)農(nóng)村水電電氣化縣建設(shè)工作。

　�。ㄊ�）水文司

　　對(duì)全國水文工作進(jìn)行行業(yè)管理；負(fù)責(zé)部屬水文站網(wǎng)的建設(shè)和管理；組織全國水資源調(diào)查評(píng)價(jià)。

　�。ㄊ�一）水利管理司

　　負(fù)責(zé)河道、水庫、湖泊、海堤等水域、岸線、河口灘涂以及水利水電工程的管理和保護(hù)；對(duì)江河和水利工程的防洪安全進(jìn)行行業(yè)管理；對(duì)全國水庫大壩安全實(shí)施監(jiān)督管理；歸口管理水庫漁業(yè)和水利旅游事業(yè)。

　�。ㄊ�二）農(nóng)村水利司

　　主管農(nóng)田水利、灌區(qū)、機(jī)排灌站以及牧區(qū)水利和鄉(xiāng)鎮(zhèn)供水、人畜飲水工作；組織指導(dǎo)全國農(nóng)田水利基本建設(shè)和農(nóng)村水利社會(huì)化服務(wù)體系建設(shè)；負(fù)責(zé)農(nóng)村節(jié)水工作。

　�。ㄊ�三）水土保持司

　　主管全國水土保持工作，組織全國水土保持重點(diǎn)治理區(qū)的工作，協(xié)調(diào)水土流失綜合治理；對(duì)有關(guān)法律、法規(guī)的執(zhí)行情況依法實(shí)施監(jiān)督。

　　（十四）機(jī)關(guān)黨委

　　負(fù)責(zé)部機(jī)關(guān)及在京直屬單位的黨群工作。

　　四、人員編制和領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)

　　水利部機(jī)關(guān)行政編制為365名。其中，部長1名，副部長4名；正副司局長44名（含正、副總工程師各1名，機(jī)關(guān)黨委專職副書記2名、機(jī)關(guān)紀(jì)委專職書記1名）。

　　紀(jì)檢、監(jiān)察、審計(jì)等派駐機(jī)構(gòu)和參事、老干部、后勤服務(wù)機(jī)構(gòu)及編制，按有關(guān)規(guī)定另行核定。

　　國家防汛抗旱總指揮部辦公室仍單獨(dú)設(shè)立，其事業(yè)編制另行核定。

　　因機(jī)構(gòu)改革和人員分流需組建的事業(yè)單位，按有關(guān)規(guī)定辦理審批手續(xù)。

　　五、關(guān)于理順和電力部關(guān)系的幾個(gè)問題

　　經(jīng)水利、電力兩部協(xié)商議定：

　�。ㄒ唬┧�電是水資源綜合利用的一個(gè)重要方面，水電規(guī)劃（包括小水電和小電網(wǎng)建設(shè)規(guī)劃）應(yīng)符合流域規(guī)劃和電力發(fā)展規(guī)劃。水利部負(fù)責(zé)開發(fā)以防洪、灌溉、供水為主的水電站，原水利部門管理的大中型水電站、小水電及其小電網(wǎng)，仍由水利部門管理。今后水電站建設(shè)管理，隨著市場經(jīng)濟(jì)的發(fā)展和完善，按照“誰投資、誰受益”的原則，推行業(yè)主責(zé)任制，由業(yè)主負(fù)責(zé)建設(shè)管理。水電站建成后，凡與大電網(wǎng)相聯(lián)的，按照并網(wǎng)協(xié)議，由電網(wǎng)實(shí)行統(tǒng)一調(diào)度。

　�。ǘ�）大、小電網(wǎng)交叉供電的地區(qū)，應(yīng)統(tǒng)籌規(guī)劃，避免重復(fù)建設(shè)，實(shí)現(xiàn)共同發(fā)展。

　�。ㄈ�）水電站水庫的運(yùn)用，原則上應(yīng)按設(shè)計(jì)文件執(zhí)行。以發(fā)電為主的水庫，汛期組成有電力部門參加的防汛指揮部，汛限起調(diào)水位以上防洪庫容及供水調(diào)度運(yùn)用，要服從防汛抗旱指揮部的統(tǒng)一調(diào)度；汛限起調(diào)水位的變更和確定，由水庫大壩主管部門商省防汛指揮部門確定；汛限起調(diào)水位以下的興利庫容運(yùn)用中有關(guān)灌溉、供水等水資源綜合利用，由水利部門提出建議商電力部門確定。水電站的調(diào)度，由電力部門負(fù)責(zé)。

　�。ㄋ模┺r(nóng)村電氣化由電力部歸口。水利部負(fù)責(zé)國務(wù)院安排的第二批200個(gè)農(nóng)村水電電氣化縣建設(shè)工作。

　�。ㄎ澹╆P(guān)于水利部同原能源部共管的單位，應(yīng)在明確水利、電力兩部職能分工的基礎(chǔ)上協(xié)商解決。

　　六、七大流域機(jī)構(gòu)的職能

　　長江、黃河、淮河、海河、珠江、松遼水利委員會(huì)和太湖流域管理局等七個(gè)流域機(jī)構(gòu)是水利部的派出機(jī)構(gòu)，國家授權(quán)對(duì)其所在流域行使水行政主管部門的職責(zé)。